Maakuntaohjelman toimeenpanosuunnitelmassa määritellään maakuntaohjelman toteuttamisen seuraavien vuosien painotukset ja keskeiset toimenpiteet sekä rahoituksesta vastaavat tahot. Toimeenpanosuunnitelmaan sisältyy rakennerahastovaroja koskeva rahoitussuunnitelma.
Maakuntaohjelmaa toteutetaan neljällä toimintalinjalla, joiksi on valittu liiketoimintaympäristö, asuin- ja kulttuuriympäristö, osaamis- ja innovaatioympäristö sekä liikenneyhteydet ja liikennejärjestelmä. Kaikilla toimintalinjoilla edistetään läpileikkaavasti biotalouden, digitalisaation ja logistiikan lisäksi kestävää kehitystä ja kansainvälistymistä. Lisäksi toimintalinjojen välillä on selkeitä yhteneväisyyksiä.
